Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka4Q9Z2B9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms