Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms