Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms