Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup160Q9Z0W3 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms