Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms