Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin2Q9WVE8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms