Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme3Q9WV85 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms