Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp1a4Q9WV27 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms