Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU39

Scnn1g, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1gQ9WU39 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Scnn1gQ9WU39 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Scnn1gQ9WU39 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Scnn1gQ9WU39 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Scnn1gQ9WU39 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Scnn1gQ9WU39 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Scnn1gQ9WU39 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Scnn1gQ9WU39 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Scnn1gQ9WU39 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Scnn1gQ9WU39 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Scnn1gQ9WU39 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Scnn1gQ9WU39 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scnn1gQ9WU39 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scnn1gQ9WU39 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scnn1gQ9WU39 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scnn1gQ9WU39 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scnn1gQ9WU39 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scnn1gQ9WU39 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scnn1gQ9WU39 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scnn1gQ9WU39 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scnn1gQ9WU39 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scnn1gQ9WU39 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scnn1gQ9WU39 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scnn1gQ9WU39 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scnn1gQ9WU39 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scnn1gQ9WU39 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scnn1gQ9WU39 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Scnn1gQ9WU39 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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