Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sema6cQ9WTM3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sema6cQ9WTM3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sema6cQ9WTM3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sema6cQ9WTM3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sema6cQ9WTM3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sema6cQ9WTM3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sema6cQ9WTM3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sema6cQ9WTM3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sema6cQ9WTM3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sema6cQ9WTM3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sema6cQ9WTM3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sema6cQ9WTM3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sema6cQ9WTM3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sema6cQ9WTM3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sema6cQ9WTM3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sema6cQ9WTM3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sema6cQ9WTM3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sema6cQ9WTM3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sema6cQ9WTM3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sema6cQ9WTM3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sema6cQ9WTM3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sema6cQ9WTM3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sema6cQ9WTM3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sema6cQ9WTM3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sema6cQ9WTM3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sema6cQ9WTM3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sema6cQ9WTM3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sema6cQ9WTM3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sema6cQ9WTM3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sema6cQ9WTM3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sema6cQ9WTM3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sema6cQ9WTM3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sema6cQ9WTM3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sema6cQ9WTM3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sema6cQ9WTM3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sema6cQ9WTM3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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