Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trpc2Q9R244 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms