Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms