Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1T4

Sept6, Septin-6, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept6Q9R1T4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sept6Q9R1T4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sept6Q9R1T4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sept6Q9R1T4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sept6Q9R1T4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sept6Q9R1T4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sept6Q9R1T4 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sept6Q9R1T4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sept6Q9R1T4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sept6Q9R1T4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sept6Q9R1T4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sept6Q9R1T4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sept6Q9R1T4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sept6Q9R1T4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sept6Q9R1T4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sept6Q9R1T4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sept6Q9R1T4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sept6Q9R1T4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sept6Q9R1T4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sept6Q9R1T4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sept6Q9R1T4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sept6Q9R1T4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sept6Q9R1T4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sept6Q9R1T4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sept6Q9R1T4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sept6Q9R1T4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sept6Q9R1T4 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sept6Q9R1T4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sept6Q9R1T4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sept6Q9R1T4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sept6Q9R1T4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sept6Q9R1T4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sept6Q9R1T4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms