Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms