Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms