Protein–RNA interactions for Protein: Q9R069

Bcam, Basal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcamQ9R069 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BcamQ9R069 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BcamQ9R069 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BcamQ9R069 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BcamQ9R069 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BcamQ9R069 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BcamQ9R069 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BcamQ9R069 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms