Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AmfrQ9R049 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms