Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Col4a3Q9QZS0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Col4a3Q9QZS0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Col4a3Q9QZS0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Col4a3Q9QZS0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Col4a3Q9QZS0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Col4a3Q9QZS0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Col4a3Q9QZS0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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