Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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Trpc3Q9QZC1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Trpc3Q9QZC1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Trpc3Q9QZC1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Trpc3Q9QZC1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Trpc3Q9QZC1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc3Q9QZC1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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