Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms