Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nphp1Q9QY53 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nphp1Q9QY53 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms