Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY40

Plxnb3, Plexin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 1,902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb3Q9QY40 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxnb3Q9QY40 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxnb3Q9QY40 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxnb3Q9QY40 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxnb3Q9QY40 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxnb3Q9QY40 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxnb3Q9QY40 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxnb3Q9QY40 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxnb3Q9QY40 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxnb3Q9QY40 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxnb3Q9QY40 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxnb3Q9QY40 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxnb3Q9QY40 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxnb3Q9QY40 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plxnb3Q9QY40 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms