Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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Foxe3Q9QY14 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms