Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Kcnip3Q9QXT8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Kcnip3Q9QXT8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Kcnip3Q9QXT8 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Kcnip3Q9QXT8 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Kcnip3Q9QXT8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms