Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cpsf3Q9QXK7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf3Q9QXK7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf3Q9QXK7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf3Q9QXK7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf3Q9QXK7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf3Q9QXK7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf3Q9QXK7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf3Q9QXK7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf3Q9QXK7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf3Q9QXK7 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf3Q9QXK7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf3Q9QXK7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf3Q9QXK7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf3Q9QXK7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf3Q9QXK7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms