Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lsm4Q9QXA5 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms