Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms