Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rfx5Q9JL61 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Rfx5Q9JL61 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Rfx5Q9JL61 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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Rfx5Q9JL61 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Rfx5Q9JL61 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Rfx5Q9JL61 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Rfx5Q9JL61 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx5Q9JL61 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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