Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms