Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms