Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Msgn1Q9JK54 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Msgn1Q9JK54 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Msgn1Q9JK54 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Msgn1Q9JK54 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Msgn1Q9JK54 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msgn1Q9JK54 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msgn1Q9JK54 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msgn1Q9JK54 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msgn1Q9JK54 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msgn1Q9JK54 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msgn1Q9JK54 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msgn1Q9JK54 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msgn1Q9JK54 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msgn1Q9JK54 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msgn1Q9JK54 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msgn1Q9JK54 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msgn1Q9JK54 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msgn1Q9JK54 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Msgn1Q9JK54 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msgn1Q9JK54 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msgn1Q9JK54 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msgn1Q9JK54 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msgn1Q9JK54 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msgn1Q9JK54 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Msgn1Q9JK54 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Msgn1Q9JK54 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msgn1Q9JK54 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msgn1Q9JK54 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msgn1Q9JK54 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msgn1Q9JK54 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msgn1Q9JK54 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msgn1Q9JK54 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms