Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Zfhx4Q9JJN2 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms