Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms