Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

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Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Smad9Q9JIW5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Smad9Q9JIW5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Smad9Q9JIW5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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