Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pus3Q9JI38 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms