Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERT2

Trhr2, Thyrotropin-releasing hormone receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trhr2Q9ERT2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trhr2Q9ERT2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms