Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms