Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ41

Vmn1r29, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r29Q9EQ41 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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Vmn1r29Q9EQ41 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Vmn1r29Q9EQ41 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r29Q9EQ41 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Vmn1r29Q9EQ41 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Vmn1r29Q9EQ41 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Vmn1r29Q9EQ41 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r29Q9EQ41 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Vmn1r29Q9EQ41 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vmn1r29Q9EQ41 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Vmn1r29Q9EQ41 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Vmn1r29Q9EQ41 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Vmn1r29Q9EQ41 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Vmn1r29Q9EQ41 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r29Q9EQ41 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r29Q9EQ41 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r29Q9EQ41 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r29Q9EQ41 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r29Q9EQ41 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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