Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SgshQ9EQ08 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms