Protein–RNA interactions for Protein: Q9DD03

Rab13, Ras-related protein Rab-13, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab13Q9DD03 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab13Q9DD03 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms