Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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