Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SrpraQ9DBG7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrpraQ9DBG7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms