Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ftsj3Q9DBE9 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms