Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Smg9Q9DB90 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Smg9Q9DB90 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Smg9Q9DB90 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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Smg9Q9DB90 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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Smg9Q9DB90 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Smg9Q9DB90 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms