Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Znf580Q9DB38 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Znf580Q9DB38 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Znf580Q9DB38 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf580Q9DB38 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf580Q9DB38 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf580Q9DB38 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf580Q9DB38 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Znf580Q9DB38 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf580Q9DB38 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf580Q9DB38 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Znf580Q9DB38 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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