Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms