Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms