Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9bQ9D6E4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms