Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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