Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al3Q9D4U4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al3Q9D4U4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al3Q9D4U4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al3Q9D4U4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al3Q9D4U4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al3Q9D4U4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al3Q9D4U4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al3Q9D4U4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al3Q9D4U4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al3Q9D4U4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al3Q9D4U4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al3Q9D4U4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al3Q9D4U4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al3Q9D4U4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al3Q9D4U4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al3Q9D4U4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al3Q9D4U4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al3Q9D4U4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al3Q9D4U4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al3Q9D4U4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al3Q9D4U4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al3Q9D4U4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al3Q9D4U4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al3Q9D4U4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al3Q9D4U4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al3Q9D4U4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al3Q9D4U4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al3Q9D4U4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al3Q9D4U4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms